Bước đầu xây dựng bộ chỉ thị SSR của DNA dưa leo và nhiệt độ bắt cặp tối ưu của các mồi SSR cho phản ứng PCR

Lương Hiếu Ngân, Hồ Thị Bích Phượng, Nguyễn Như Thành, Hoàng Thị Thuỳ, Cao Tiến Sang, Vũ Quốc Trưởng, Linh Thị Trúc Lê () and Lê Thị Kính
Additional contact information
Lương Hiếu Ngân: Nghiên cứu tự do, Thành phố Hồ Chí Minh, Việt Nam
Hồ Thị Bích Phượng: Nghiên cứu tự do, Thành phố Hồ Chí Minh, Việt Nam
Nguyễn Như Thành: Công ty TNHH Hạt giống Tân Lộc Phát, Việt Nam
Hoàng Thị Thuỳ: Công ty TNHH Hạt giống Tân Lộc Phát, Việt Nam
Cao Tiến Sang: Công ty TNHH Hạt giống Tân Lộc Phát, Việt Nam
Vũ Quốc Trưởng: Công ty TNHH Hạt giống Tân Lộc Phát, Việt Nam
Linh Thị Trúc Lê: Trường Đại Học Mở Thành phố Hồ Chí Minh, Việt Nam
Lê Thị Kính: Trường Đại Học Mở Thành phố Hồ Chí Minh, Việt Nam

TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ, 2021, vol. 16, issue 1, 112-125

Abstract: Bản đồ liên kết phân tử với mật độ chỉ thị cao cần được xác định trước khi thực hiện chọn giống bằng DNA marker trong đó các chỉ thị này có sự liên kết chặt với các tính trạng quan tâm. SSR (Simple Sequence Repeat - Trình tự lặp lại đơn giản) là một marker phân tử được dùng để xây dựng bản dồ liên kết phân tử và có thể phân biệt được các dạng dị hợp và đồng hợp của gene. Mục tiêu của nghiên cứu là xây dựng bộ chỉ thị SSR có liên kết với các tính trạng quan trọng trong chọn giống dưa leo và xác định được điều kiện tối ưu cho phản ứng PCR khuyếch đại DNA dưa leo từ những SSR này. Thực hiện khai thác in silico để xây dựng bộ dữ liệu SSR. Tối ưu hoá phản ứng PCR bằng chạy gradient nhiệt độ cho các mồi SSR. Chúng tôi đã xác định được 52 SSR có liên kết với các tính trạng quan trọng trong chọn giống dưa leo. Điều kiện nhiệt độ bắt cặp tối ưu 46 SSR trong phản ứng PCR khuếch đại DNA dưa leo đã được xác định. Đây là dữ liệu quan trọng cho bước sàng lọc các cây phân ly trong quá trình chọn giống dưa leo tiếp sau đó.

Keywords: chọn giống; chỉ dấu phân tử; dưa leo; SSR (search for similar items in EconPapers)
Date: 2021
References: Add references at CitEc
Citations:

Downloads: (external link)
https://journalofscience.ou.edu.vn/index.php/tech-vi/article/view/1872/1532 (application/pdf)

Related works:
This item may be available elsewhere in EconPapers: Search for items with the same title.

Export reference: BibTeX RIS (EndNote, ProCite, RefMan) HTML/Text

Persistent link: https://EconPapers.repec.org/RePEc:bjw:techvi:v:16:y:2021:i:1:p:112-125

DOI: 10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.16.1.1872.2021

Access Statistics for this article

TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ is currently edited by Nguyen Thuan

More articles in TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ from HO CHI MINH CITY OPEN UNIVERSITY JOURNAL OF SCIENCE, HO CHI MINH CITY OPEN UNIVERSITY
Bibliographic data for series maintained by Vu Tuan Truong ().