Bước đầu Nghiên cứu sự Hiện diện của Sri Lankan Cassava Mosaic Virus (SLCMV) trên Sắn (Manihot esculenta Crantz 1766)

Trương Thị Huỳnh Như, Huỳnh Thị Ngọc Mai, Lê Hồng Kông, Trần Trung Chánh, Phạm Thị Nhạn, Lê Khanh, Phạm Quốc An and Nguyễn Hữu Hoàng ()
Additional contact information
Trương Thị Huỳnh Như: Trường Đại học Khoa học Tự nhiên
Huỳnh Thị Ngọc Mai: Trường Đại học Khoa học Tự nhiên
Lê Hồng Kông: Trường Đại học Khoa học Tự nhiên
Trần Trung Chánh: Trường Đại học Khoa học Tự nhiên
Phạm Thị Nhạn: Trung tâm Nghiên cứu Thực nghiệm Nông nghiệp Hưng Lộc, tỉnh Đồng Nai, Việt Nam
Lê Khanh: Cisbay Global Inc., California
Phạm Quốc An: Trường Đại học Khoa học Tự nhiên
Nguyễn Hữu Hoàng: Trường Đại học Khoa học Tự nhiên

TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ, 2022, vol. 17, issue 2, 5-20

Abstract: Các khảo cứu về Sri Lankan Cassava Mosaic Virus (SLCMV) ở tải lượng virus thấp trên cây sắn (Manihot esculenta Crantz 1766), đặc biệt là giống kháng virus hoặc giống sạch bệnh thường đòi hỏi cao về hiệu suất tách chiết và phát hiện DNA mạch đơn của virus (ssDNA). Trong nghiên cứu, bốn quy trình ly trích DNA tổng sổ khác nhau được dùng nhằm mục đích tách được hàm lượng ssDNA cao. Đồng thời, sử dụng quy trình Polymerase chain reaction (PCR) và Real-time PCR (RT-PCR) để phát hiện sự hiện diện của SLCMV với các cặp mồi nhân bản gen Rep/AC1 của virus và cặp mồi nhân bản gen nội chuẩn Beta-Actin của sắn. Kết quả cho thấy, quy trình ly trích DNA cải tiến từ Mason, Caciagli, Accotto và Noris (2008) và Osena, Nyaboga và Amugune (2017), tạm gọi là R-kit, cho hàm lượng ssDNA tương đối cao tại vị trí thùy lá, được đề nghị sử dụng. Quy trình PCR và RT-PCR kiểm tra được sự hiện diện của SLCMV trên vật liệu nhiễm bệnh. Ngoài ra, quy trình RT-PCR với cặp mồi SqPCR1 và probe đặc hiệu cho phép phát hiện tín hiệu SLCMV trong mẫu lá bệnh. Hệ số nhân bản gen của cặp mồi SqPCR1 (1.851X) và Beta-Actin (1.896X) cho phép thực hiện đồng thời và phân tích kết quả cùng nhau. Ngưỡng phát hiện của RT-PCR cũng ở mức pha loãng cao hơn PCR cơ sở hỗ trợ các khảo cứu SLCMV ở tải lượng thấp trên cây mô hình và giống kháng.

Keywords: Begomovirus; bệnh học; sinh học phân tử virus; xét nghiệm (search for similar items in EconPapers)
Date: 2022
References: Add references at CitEc
Citations:

Downloads: (external link)
https://journalofscience.ou.edu.vn/index.php/tech-vi/article/view/2194/1737 (application/pdf)

Related works:
This item may be available elsewhere in EconPapers: Search for items with the same title.

Export reference: BibTeX RIS (EndNote, ProCite, RefMan) HTML/Text

Persistent link: https://EconPapers.repec.org/RePEc:bjw:techvi:v:17:y:2022:i:2:p:5-20

DOI: 10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.17.2.2194.2022

Access Statistics for this article

TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ is currently edited by Nguyen Thuan

More articles in TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ from HO CHI MINH CITY OPEN UNIVERSITY JOURNAL OF SCIENCE, HO CHI MINH CITY OPEN UNIVERSITY
Bibliographic data for series maintained by Vu Tuan Truong ().