Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities

A. C. R. da Silva (), J. A. Ferro, F. C. Reinach, C. S. Farah, L. R. Furlan, R. B. Quaggio, C. B. Monteiro-Vitorello, M. A. Van Sluys, N. F. Almeida, L. M. C. Alves, A. M. do Amaral, M. C. Bertolini, L. E. A. Camargo, G. Camarotte, F. Cannavan, J. Cardozo, F. Chambergo, L. P. Ciapina, R. M. B. Cicarelli, L. L. Coutinho, J. R. Cursino-Santos, H. El-Dorry, J. B. Faria, A. J. S. Ferreira, R. C. C. Ferreira, M. I. T. Ferro, E. F. Formighieri, M. C. Franco, C. C. Greggio, A. Gruber, A. M. Katsuyama, L. T. Kishi, R. P. Leite, E. G. M. Lemos, M. V. F. Lemos, E. C. Locali, M. A. Machado, A. M. B. N. Madeira, N. M. Martinez-Rossi, E. C. Martins, J. Meidanis, C. F. M. Menck, C. Y. Miyaki, D. H. Moon, L. M. Moreira, M. T. M. Novo, V. K. Okura, M. C. Oliveira, V. R. Oliveira, H. A. Pereira, A. Rossi, J. A. D. Sena, C. Silva, R. F. de Souza, L. A. F. Spinola, M. A. Takita, R. E. Tamura, E. C. Teixeira, R. I. D. Tezza, M. Trindade dos Santos, D. Truffi, S. M. Tsai, F. F. White, J. C. Setubal and J. P. Kitajima
Additional contact information
A. C. R. da Silva: Universidade de São Paulo
J. A. Ferro: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
F. C. Reinach: Universidade de São Paulo
C. S. Farah: Universidade de São Paulo
L. R. Furlan: Universidade Estadual Paulista, Fazenda Lageado
R. B. Quaggio: Universidade de São Paulo
C. B. Monteiro-Vitorello: Universidade de São Paulo
M. A. Van Sluys: Departamento de Botânica, Instituto de Biociências, Rua do Matão 277
N. F. Almeida: Universidade Federal de Mato Grosso do Sul
L. M. C. Alves: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
A. M. do Amaral: Centro de Citricultura Sylvio Moreira—IAC
M. C. Bertolini: Universidade Estadual Paulista
L. E. A. Camargo: Universidade de São Paulo
G. Camarotte: Universidade de São Paulo
F. Cannavan: Centro de Energia Nuclear na Agricultura
J. Cardozo: Universidade Estadual Paulista
F. Chambergo: Universidade de São Paulo
L. P. Ciapina: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
R. M. B. Cicarelli: Universidade Estadual Paulista
L. L. Coutinho: Universidade de São Paulo
J. R. Cursino-Santos: Universidade de São Paulo
H. El-Dorry: Universidade de São Paulo
J. B. Faria: Universidade de São Paulo
A. J. S. Ferreira: Universidade de São Paulo
R. C. C. Ferreira: Universidade de São Paulo
M. I. T. Ferro: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
E. F. Formighieri: Centro de Energia Nuclear na Agricultura
M. C. Franco: Centro de Energia Nuclear na Agricultura
C. C. Greggio: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
A. Gruber: Universidade de São Paulo
A. M. Katsuyama: Universidade de São Paulo
L. T. Kishi: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
R. P. Leite: Instituto de Tecnologia do Paraná, IAPAR
E. G. M. Lemos: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
M. V. F. Lemos: Universidade Estadual Paulista
E. C. Locali: Centro de Citricultura Sylvio Moreira—IAC
M. A. Machado: Centro de Citricultura Sylvio Moreira—IAC
A. M. B. N. Madeira: Universidade de São Paulo
N. M. Martinez-Rossi: Universidade de São Paulo
E. C. Martins: Universidade Estadual Paulista
J. Meidanis: Universidade Estadual de Campinas
C. F. M. Menck: Universidade de São Paulo
C. Y. Miyaki: Departamento de Biologica, Instituto de Biociências
D. H. Moon: Centro de Energia Nuclear na Agricultura
L. M. Moreira: Universidade de São Paulo
M. T. M. Novo: Universidade Estadual Paulista
V. K. Okura: Universidade Estadual de Campinas
M. C. Oliveira: Departamento de Botânica, Instituto de Biociências, Rua do Matão 277
V. R. Oliveira: Universidade de São Paulo
H. A. Pereira: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
A. Rossi: Universidade de São Paulo
J. A. D. Sena: Universidade Estadual Paulista
C. Silva: Universidade de São Paulo
R. F. de Souza: Universidade de São Paulo
L. A. F. Spinola: Universidade de São Paulo
M. A. Takita: Centro de Citricultura Sylvio Moreira—IAC
R. E. Tamura: Universidade de São Paulo
E. C. Teixeira: Universidade Estadual Paulista
R. I. D. Tezza: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
M. Trindade dos Santos: Universidade de São Paulo
D. Truffi: Universidade de São Paulo
S. M. Tsai: Centro de Energia Nuclear na Agricultura
F. F. White: Universidade Estadual Paulista, Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane s/n
J. C. Setubal: Universidade Estadual de Campinas
J. P. Kitajima: Universidade Estadual de Campinas

Nature, 2002, vol. 417, issue 6887, 459-463

Abstract: Abstract The genus Xanthomonas is a diverse and economically important group of bacterial phytopathogens, belonging to the γ-subdivision of the Proteobacteria. Xanthomonas axonopodis pv. citri (Xac) causes citrus canker, which affects most commercial citrus cultivars, resulting in significant losses worldwide. Symptoms include canker lesions, leading to abscission of fruit and leaves and general tree decline1. Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) causes black rot, which affects crucifers such as Brassica and Arabidopsis. Symptoms include marginal leaf chlorosis and darkening of vascular tissue, accompanied by extensive wilting and necrosis2. Xanthomonas campestris pv. campestris is grown commercially to produce the exopolysaccharide xanthan gum, which is used as a viscosifying and stabilizing agent in many industries3. Here we report and compare the complete genome sequences of Xac and Xcc. Their distinct disease phenotypes and host ranges belie a high degree of similarity at the genomic level. More than 80% of genes are shared, and gene order is conserved along most of their respective chromosomes. We identified several groups of strain-specific genes, and on the basis of these groups we propose mechanisms that may explain the differing host specificities and pathogenic processes.

Date: 2002
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